<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div>Dear all,<br></div>several important changes happened recently in fedora medical. The following packages were added:<br>

<br></div>* InsightToolkit (ITK)- Kitware flagship medical image analysis library<br></div>* Orthanc - Lightweight PACS<br></div>* octave-dicom - Dicom package for octave<br></div><div>* gdcm bumped up to last release<br>

</div><div><br></div>Especially ITK was a big jump after almost 4 years of review! It now unblocks a wide range of medical imaging software such as:<br><br></div>* elastix - image registration<br></div>* GinkoCAD - DICOM viewer<br>

</div>* ITKSnap - Segmentation<br></div>* Seg3D 2 - Segmentation<br></div>* vmtk - Vascular modeling kit<br></div><div>* msvtk - Multi-scale visualization toolkit <br></div><div><br></div>On another side, Orthanc enables Fedora to act as a PACS to interchange dicom images between several peers.<br>

<br></div>I think it would be nice to concentrate now in having a working and integrated dicom viewer (GinkoCAD) and segmentation program (Seg3D2 or ITKSnap).<br><br></div>Maybe, with some effort, we might even propose three features for one of the next fedora releases: <br>

<br>* &quot;medical image platform clinic&quot; which would include:<br>a) improved dicom compatilibity (already done with dcmtk, gdcm, octave-dicom)<br>b) pacs support (orthanc, already done) + GinkoCAD<br></div><div>c) InsightToolkit (already done)<br>

</div>d) segmentation tools (ITKSnap + Seg3d 2)<br></div><br>* &quot;medical image platform research&quot; which would include:<br>a) 3D slicer<br>b) registration tools (elastix + ants)<br></div>c) statistical shape models (statismo + shapeworks)<br>

</div>d) vascular analysis (vmtk)<br></div>e) guided surgery (openigtlink, already done + IGSTK)<br><div><div><div><div><br><div>* &quot;biomechanical platform&quot; which would include:<br></div><div>a) Meshing (Biomesh3d, cleaver, stellar)<br>

</div><div>b) FEM code (Elmer, Kratos, OpenPalm, OpenFOAM)<br></div><div>c) Salome modeler<br></div><div><br>An updated page with current status of all these packages is:<br><a href="https://fedoraproject.org/wiki/Medical_Imaging">https://fedoraproject.org/wiki/Medical_Imaging</a><br>

<br></div><div>Probably some of those packages are already included in Debian/Ubuntu and we can contact our fellow packagers for help with patches.<br><br></div><div>Is there anyone interested in all of this?<br></div><div>

<br></div><div>Best,<br><br></div><div>Mario<br></div><div><br><br><br><br><div><br><br><br><br><div><br><br></div></div></div></div></div></div></div></div>